Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Necab3Q9D6J4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necab3Q9D6J4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms