Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930449I24RikQ9D5E3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930449I24RikQ9D5E3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms