Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr3eQ9CZT4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3eQ9CZT4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms