Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins3Q9CY94 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms