Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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