Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca4Q9CWM2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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