Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atxn3Q9CVD2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn3Q9CVD2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms