Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930519P11RikQ9CUJ8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms