Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn4rQ99PI8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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