Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms