Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lysmd3Q99LE3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lysmd3Q99LE3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lysmd3Q99LE3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lysmd3Q99LE3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lysmd3Q99LE3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lysmd3Q99LE3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lysmd3Q99LE3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lysmd3Q99LE3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lysmd3Q99LE3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lysmd3Q99LE3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms