Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Emc3Q99KI3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms