Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms