Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrm1Q99J25 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrm1Q99J25 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms