Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfxn4Q925N1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms