Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1bQ91YK2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms