Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms