Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco4Q91WU4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms