Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms