Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms