Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms