Protein–RNA interactions for Protein: Q8K445

Clrn1, Clarin-1, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn1Q8K445 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Clrn1Q8K445 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Clrn1Q8K445 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Clrn1Q8K445 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Clrn1Q8K445 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Clrn1Q8K445 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Clrn1Q8K445 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Clrn1Q8K445 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clrn1Q8K445 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clrn1Q8K445 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clrn1Q8K445 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clrn1Q8K445 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clrn1Q8K445 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn1Q8K445 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms