Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms