Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd3Q8K2C9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms