Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Abcf3Q8K268 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Abcf3Q8K268 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Abcf3Q8K268 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Abcf3Q8K268 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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