Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cpne5Q8JZW4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms