Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrip1Q8CBD1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms