Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup107Q8BH74 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup107Q8BH74 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup107Q8BH74 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup107Q8BH74 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup107Q8BH74 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup107Q8BH74 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup107Q8BH74 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup107Q8BH74 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup107Q8BH74 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup107Q8BH74 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup107Q8BH74 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup107Q8BH74 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup107Q8BH74 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms