Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ubash3bQ8BGG7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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