Protein–RNA interactions for Protein: Q80W99

Catsper3, Cation channel sperm-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper3Q80W99 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper3Q80W99 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms