Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja2Q80U04 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms