Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms