Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letm2Q7TNU7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letm2Q7TNU7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letm2Q7TNU7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letm2Q7TNU7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letm2Q7TNU7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letm2Q7TNU7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letm2Q7TNU7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Letm2Q7TNU7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Letm2Q7TNU7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Letm2Q7TNU7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm2Q7TNU7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms