Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ScocQ78YZ6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ScocQ78YZ6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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