Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim45Q6PFY8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms