Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms