Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mvb12bQ6KAU4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mvb12bQ6KAU4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms