Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt72Q6IME9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms