Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt39Q6IFX4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms