Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VclQ64727 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VclQ64727 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VclQ64727 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VclQ64727 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VclQ64727 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VclQ64727 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VclQ64727 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VclQ64727 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VclQ64727 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VclQ64727 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VclQ64727 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VclQ64727 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VclQ64727 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VclQ64727 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms