Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Taf6Q62311 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Taf6Q62311 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Taf6Q62311 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Taf6Q62311 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms