Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Itga6Q61739 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga6Q61739 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms