Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msi1Q61474 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms