Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamb3Q61087 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms