Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms