Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms