Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms