Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk2a1Q60737 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms