Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms