Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms